Аутор Тема: Хаплогрупа J1-PF7263, покушај историјске реконструкције  (Прочитано 83166 пута)

David Radonić

  • Гост
Одг: Хаплогрупа J1-PF7263, покушај историјске реконструкције
« Одговор #60 послато: јун 08, 2015, 02:45:43 поподне »
Svaka čast na obavljenom poslu Nebojša

Za makedonski uzorak mislim da ne pripada našoj grupi, najviše zbog vrednosti 12 na markeru 19. U J1 grupi je najčešća vrednost 14, ima i vrednosti 15, 13 mnogo manje, ne sećam se da sam negde video 12, u svakom slučaju ne u PF7263. Mislim da nije naš

Slovenac je sigurno naš, s tim što je rezultat koji je bio podudaran sa mnom imao 439-11. Probaj, ako može da za marker 458 uneseš vrednost 17.2 (ne samo 17), baš me zanima što će onda ispasti.

Ako uporedimo slike 1 i 2, i ako bude ispala još jedna slika sa markerom 458-17.2, ispašće da je naš haplotip mnogo rašireniji nego što sam mislio, ali isto skoncentrisan na Dinarsko gorje i okolne prostore.

Ван мреже Небојша

  • Уредник СДНКП
  • Бели орао
  • *****
  • Поруке: 7980
Одг: Хаплогрупа J1-PF7263, покушај историјске реконструкције
« Одговор #61 послато: јун 08, 2015, 04:15:19 поподне »
Slovenac je sigurno naš, s tim što je rezultat koji je bio podudaran sa mnom imao 439-11. Probaj, ako može da za marker 458 uneseš vrednost 17.2 (ne samo 17), baš me zanima što će onda ispasti.

Ako uporedimo slike 1 i 2, i ako bude ispala još jedna slika sa markerom 458-17.2, ispašće da je naš haplotip mnogo rašireniji nego što sam mislio, ali isto skoncentrisan na Dinarsko gorje i okolne prostore.

Иста је ситуација и са DYS458 17.2 (и код вас 13-19 и код Јаковића).


J1-PF7263


David Radonić

  • Гост
Одг: Хаплогрупа J1-PF7263, покушај историјске реконструкције
« Одговор #62 послато: јун 08, 2015, 04:27:26 поподне »
Ok, hvala

Ван мреже Небојша

  • Уредник СДНКП
  • Бели орао
  • *****
  • Поруке: 7980
Одг: Хаплогрупа J1-PF7263, покушај историјске реконструкције
« Одговор #63 послато: јун 08, 2015, 04:59:04 поподне »
Ok, hvala

Нема на чему. И мени се чини да на Балкану играте значајнију улогу само код Срба у динарском подручју.

Ван мреже Korisnik77

  • Шегрт
  • ***
  • Поруке: 81
Одг: Хаплогрупа J1-PF7263, покушај историјске реконструкције
« Одговор #64 послато: јун 08, 2015, 08:59:07 поподне »
Da, to je ono što ja već duže vrijeme mislim, da smo došli ili sa Germanima ili sa Slovenima. Za sada imamo samo 1 Grka, 1 Crnogorca i po nekoliko haplotioova u Bosni i Hrvatskoj. Sve u svemu čini se da smo i prilikom doseljavanja sa Germanima/Slavenima došli uglavnom sa onim plemenima koja su išla više ka teritoriji Raške i zapadnije. Možda čak i sa Srbima?

Ван мреже Љиљан

  • Писар
  • *****
  • Поруке: 290
Одг: Хаплогрупа J1-PF7263, покушај историјске реконструкције
« Одговор #65 послато: јун 14, 2015, 10:54:54 поподне »
Дошло је, изгледа, до новог истраживања (http://www.biomedcentral.com/1756-0500/8/174) у оквиру којег су откривени нови снипови у ПФ7263 грани. Нисам стигао прочитати о чему се ради али видим да је Виктар убацио ове снипове па сада имамо 1. мало другачији распоред до сада откривених снипова (преко снипова октривених испитивањем Биг Ипсилона код Мореја), 2. сада је старост читаве ПФ7263 гране порасла са 3400 на 5800 година.
Ево како је до данас изгледало Ј1 ПФ7263 стабло:



Ево како сада изгледа:


Види се да је већина ЗС43** снипова смјештена сада у правоугаоник заједно са ПФ7263. То наравно не значи да им је ту мјесто, већ просто да се још увијек не зна шта с њих. Нови откривени снипови су између осталог утицали и на ажурирање процјене о старости гране. Може се ту десити још промјена, тј. може бити да је грана још старија. То ми је и прије падало на памет када сам размишљао да је код Мореја октривене седамдесет и нешто снипова. Лако се може десити да грана дође и до 7000 и више година. По новој процјени родитељски ПФ7264 је сада стар 10800г. док је раније била процјена на 5800г. Дакле процјењена старост је сада готово дупло већа. Чим стигнем прочитаћу рад, тј.  о коме се ради. На жалост неће још задуго ни један од снипова бити у понуди, да би ми као "Балканци" знали шта да тестирамо.

Ван мреже Љиљан

  • Писар
  • *****
  • Поруке: 290

Ван мреже Љиљан

  • Писар
  • *****
  • Поруке: 290
Одг: Хаплогрупа J1-PF7263, покушај историјске реконструкције
« Одговор #67 послато: јун 14, 2015, 10:57:21 поподне »

Ван мреже Љиљан

  • Писар
  • *****
  • Поруке: 290
Одг: Хаплогрупа J1-PF7263, покушај историјске реконструкције
« Одговор #68 послато: јун 14, 2015, 10:58:09 поподне »

Ван мреже Љиљан

  • Писар
  • *****
  • Поруке: 290
Одг: Хаплогрупа J1-PF7263, покушај историјске реконструкције
« Одговор #69 послато: јун 15, 2015, 02:39:00 поподне »
Sad sam uspio da pročitam rad. Radi se o ispitivanju 1194 uzorka sa Sardinije (Y dnk). Čini se da su i u drugim haplogrupama oktrili dosta novih snipova. Kome je interesantno može naći xlsx fajl na sajtu gdje se definišu novootkriveni i već postojeći snipovi (mutacije). Uzorak koji je PF7263+ je zaveden pod brojem 765 i evo kako izgledaju njegovi snipovi, tj. mutacije:
#      region   class                 position (b37)   r*. alt.   anc* haplo #init #fin    total   obs/tot   ISOGG

12489   9   X-degenerate   15650709   T   C   T   J1c   763   765      3   0.7   
12490   2   X-transposed   5190993           T   A   T   J1c   763   765      3   0.7   
12491   15   X-degenerate   18960272   A   T   A   J1c   763   765      3   0.7   
12492   9   X-degenerate   13918939   A   G   A   J1c   763   765      3   0.7   
12493   15   X-degenerate   18548530   C   G   C   J1c   763   765      3   0.7   
12494   19   X-degenerate   22863347   C   T   C   J1c   763   765      3   0.7   PF7263
12495   11   X-degenerate   17775770   C   T   C   J1c   763   765      3   0.7   
12496   11   X-degenerate   17656115   C   T   C   J1c   763   765      3   0.7   
12497   8   Heterochromatic   13384581   A   C   A   J1c   763   765      3   0.7   
12498   8   Heterochromatic   13685552   A   T   A   J1c   763   765      3   0.7   
12499   18   Heterochromatic   22243837   A   C   A   J1c   763   765      3   0.7   
12500   2   X-transposed   5259418   A   G   A   J1c   763   765      3   0.7   
12501   11   X-degenerate   17029079   T   C   T   J1c   763   765      3   0.7   
12502   6   Ampliconic   7644788   G   C   G   J1c   763   765      3   0.7   
12503   6   Ampliconic   8834145   C   G   C   J1c   763   765      3   0.7   
12504   9   X-degenerate   14292387   G   A   G   J1c   763   765      3   0.7   
12505   6   Ampliconic   7842079   C   G   C   J1c   763   765      3   0.7   PF7264
12506   11   X-degenerate   16433303   C   T   C   J1c   763   765      3   0.7   
12507   2   X-transposed   4872897   C   G   C   J1c   763   765      3   0.7   
12508   6   Ampliconic   9410608   A   G   A   J1c   763   765      3   0.7   
12509   6   Ampliconic   7661055   G   A   G   J1c   763   765      3   0.7   
12510   15   X-degenerate   19450177   G   C   G   J1c   763   765      3   0.7   
12511   11   X-degenerate   16581869   T   C   T   J1c   763   765      3   0.7   
12512   13   X-degenerate   18072155   C   T   C   J1c   763   765      3   0.7   
12513   5   X-degenerate   7106611   T   C   T   J1c   763   765      3   0.7   
12514   11   X-degenerate   17494730   T   G   T   J1c   763   765      3   0.7   
12515   17   X-degenerate   22040591   T   C   T   J1c   763   765      3   0.7   
12516   17   X-degenerate   21934479   G   A   G   J1c   763   765      3   0.7   
12517   8   Heterochromatic   13248005   T   G   T   J1c   763   765      3   0.7   
12518   8   Heterochromatic   13677750   A   C   A   J1c   763   765      3   0.7   



Vjerujem da će i druge hg imati koristi od rezultata ovog rada.

Što se PF7263+ tiče ostaje da se čeka bar još jedan bigY, te će onda, vjerujem, Victar uspjeti da ubijedi koga već treba u FTDNA da se napravi panel za testiranje u ovoj grani.

Ван мреже Љиљан

  • Писар
  • *****
  • Поруке: 290
Одг: Хаплогрупа J1-PF7263, покушај историјске реконструкције
« Одговор #70 послато: јун 15, 2015, 02:52:14 поподне »
Sad vidim da su u stvari 3 uzorka PF7263+. To su uzorci 763, 764 i 765. Izgleda da je Viktar čak došao do nekih podataka koje ja ne vidim u pomenutoj xlsx tabeli, pa je stablo razdvojio tako što je snipove ZS7731-7733 odvojio posebno (nađeni samo u uzorku br 764) od snipova ZS7734-7768 koji su nađeni u uzorku 765. Danas ću mu poslati mail, ukoliko bude bio voljan da da mišljenje o ovome.

Ван мреже Kor

  • Члан Друштва
  • Познавалац
  • *****
  • Поруке: 771
  • реверзни инжињеринг историје
Одг: Хаплогрупа J1-PF7263, покушај историјске реконструкције
« Одговор #71 послато: јун 15, 2015, 09:23:04 поподне »
Свака част момци за рад. Нисам баш у могућности тренутно да посветим више времена овој работи али ми је драго да видим да посао напредује.

Спомињете Мостар, о чему се ради? Из којег је истраживања тај хаплотим? Зати, Црна Гора, шта је ту у питању? За Словенца се не зна више детаља?

Ван мреже Небојша

  • Уредник СДНКП
  • Бели орао
  • *****
  • Поруке: 7980
Одг: Хаплогрупа J1-PF7263, покушај историјске реконструкције
« Одговор #72 послато: јун 16, 2015, 12:32:14 поподне »
Спомињете Мостар, о чему се ради? Из којег је истраживања тај хаплотим? Зати, Црна Гора, шта је ту у питању? За Словенца се не зна више детаља?

Ваш кластер се на YHRD мапи види у БиХ. Тестирање је вршено у Мостару, Сарајеву, Добоју, итд.

У базу су убачени и хаплотипови из оног истраживања на 23 маркера (100 тестираних). Тамо смо већ пронашли једног J1-PF7263.

Црногорац J1c је из "збирке 404".

Хаплотип из Љубљане је такође из анонимног истраживања. Једно је сигурно, на 23 маркера има потпуно поклапање са Јаковићем J1c.

Колико сам схватио, постоји још један Словенац J1c, али он има -1 са Радонићем?


Ван мреже Љиљан

  • Писар
  • *****
  • Поруке: 290
Одг: Хаплогрупа J1-PF7263, покушај историјске реконструкције
« Одговор #73 послато: јун 17, 2015, 09:21:14 пре подне »
Pregledao sam 2 ispitivanja Italijana (prvo ispitivanje 1509 uzoraka, drugo 292 uzorka).

U prvom ispitivavnju su korišteni vrlo čudni markeri (npr neki DYF markeri koje nisam nigdje drugo mogao naći) i u ovom ispitivanju ne nađoh ništa slično PF7263+.

Drugo ispitivanje je koristilo klasične str markere ali su čudne vrijednosti na nekim markerima. Tako YGATAH4 ima vrijednosti 18-21 što je vrlo čudno. Osim toga marker DYS 389II ima vrijednosti 15-19 dok su naše vrijednosti sve blizu 30. Ove markere sam zbog toga zanemario. Ostalo mi je zbog toga na raspolaganju svega 12 markera:

DYS19   DYS389-I   DYS390   DYS391   DYS392   DYS393   DYS437    DYS438   DYS439   DYS456   DYS458   DYS448
Moji rezultati:
13          12           24           10          11           13          14           10           12           15          17           20
Uzorak EFR31
13          12      24            10          12            13           14            10           12            15           17           20

Dakle na 12 markera je jedna razlika u markeru DYS392. Ovo, naravno, ne mora ništa da znači, jer je mali broj markera. Vidim da su uzorci svrstani po regijama čije su šifre: WCA, CLI, CMA, CCA, SIC, EFR, SAP.
Pretpostavljam da je SIC Sicilja. Ne znam šta bi trebalo biti EFR.




Ван мреже Небојша

  • Уредник СДНКП
  • Бели орао
  • *****
  • Поруке: 7980
Одг: Хаплогрупа J1-PF7263, покушај историјске реконструкције
« Одговор #74 послато: јун 17, 2015, 11:38:15 пре подне »
Pregledao sam 2 ispitivanja Italijana (prvo ispitivanje 1509 uzoraka, drugo 292 uzorka).

U prvom ispitivavnju su korišteni vrlo čudni markeri (npr neki DYF markeri koje nisam nigdje drugo mogao naći) i u ovom ispitivanju ne nađoh ništa slično PF7263+.

Drugo ispitivanje je koristilo klasične str markere ali su čudne vrijednosti na nekim markerima. Tako YGATAH4 ima vrijednosti 18-21 što je vrlo čudno. Osim toga marker DYS 389II ima vrijednosti 15-19 dok su naše vrijednosti sve blizu 30. Ove markere sam zbog toga zanemario. Ostalo mi je zbog toga na raspolaganju svega 12 markera:

DYS19   DYS389-I   DYS390   DYS391   DYS392   DYS393   DYS437    DYS438   DYS439   DYS456   DYS458   DYS448
Moji rezultati:
13          12           24           10          11           13          14           10           12           15          17           20
Uzorak EFR31
13          12      24            10          12            13           14            10           12            15           17           20

Dakle na 12 markera je jedna razlika u markeru DYS392. Ovo, naravno, ne mora ništa da znači, jer je mali broj markera. Vidim da su uzorci svrstani po regijama čije su šifre: WCA, CLI, CMA, CCA, SIC, EFR, SAP.
Pretpostavljam da je SIC Sicilja. Ne znam šta bi trebalo biti EFR.

Patterns of Y-STR variation in Italy (292)

EFR је ист. Фриули (47 тестираних, J1c - 2.13%)

https://en.wikipedia.org/wiki/Friuli

Када је вредност на YGATAH4 овако висока, мислим да треба смањити за 10. Код 389II треба сабрати вредности на 389I и 389II (12 + 15, 12 + 16, итд).

Ако је овај Италијан заиста J1c, опет није далеко од Словеније и наших PF7263.

Ван мреже Љиљан

  • Писар
  • *****
  • Поруке: 290
Одг: Хаплогрупа J1-PF7263, покушај историјске реконструкције
« Одговор #75 послато: јун 17, 2015, 12:23:26 поподне »
Ako se YgataH4 umanji za 10 a 389I i II se saberu onda se razlika između mene i ovog uzorka iz Istočne Furlanije (ili kako Slovenci kažu Julijska Krajina) povećava za još jednu razliku upravo na YgataH4 (kod mene 9 a kod Talijana 18)

Osim toga ovom metodom se dolazi do još jednog uzorka sa dvije razlike na 14 markera:

DYS19   D389I   389-II    DYS390   DYS391   DYS392   DYS393   DYS437 DYS438  DYS439  DYS456   DYS458  DYS448  YGATAH4
Moji rezultati
13        12     29         24           10    11          13          14         10          12      15      17        20        9
Uzorak SIC24
13           12   17        24           10      11        12 14      10          12      15   18.2    20          19


Pretpostavljam da je uzorak sa Sicilije, što bi opet moglo da bude posljedica dugotrajnog arapskog prisustva na ostrvu.

Ван мреже Љиљан

  • Писар
  • *****
  • Поруке: 290
Одг: Хаплогрупа J1-PF7263, покушај историјске реконструкције
« Одговор #76 послато: јун 17, 2015, 01:03:50 поподне »
Inače dopisivao sam se sa Victarom u vezi ove nove procjene starosti grane, i on kaže da su tri uzorka PF7263 koja su nađena na Sardniji dosta lošeg kvaliteta te je moguće da dijele nekih od novootkrivenih snipova a što se ovim ispitivanjem nije moglo utvrditi (očitati), te bi to dovelo do manjeg TMRCA. Po njemu je vrijednost od 5800g maksimalna, i vjerovatnije je nešto manja. Preko FB sam pokušao animirati nekoliko članova koji su PF7263+ da neko od njih uradi bigY ali izgleda bez uspjeha. Kad bi se kako moglo doći do kontatka sa fudbalerom Jakovićem, on bi bio dobar kandidat, jer je vjerovatno rod sa March-om. Pokušavao sam ga kontaktirati preko FB ali se čini da ne koristi FB, jer su mu svi postovi na FB stari više od godinu dana. Napisao sam mu i privatnu poruku na FB ali bez odgovora

Ван мреже Kor

  • Члан Друштва
  • Познавалац
  • *****
  • Поруке: 771
  • реверзни инжињеринг историје
Одг: Хаплогрупа J1-PF7263, покушај историјске реконструкције
« Одговор #77 послато: јун 18, 2015, 10:51:30 поподне »
А какав је у питању хаплотип који је приказан на горњој карти у Новом саду?

Ван мреже Небојша

  • Уредник СДНКП
  • Бели орао
  • *****
  • Поруке: 7980
Одг: Хаплогрупа J1-PF7263, покушај историјске реконструкције
« Одговор #78 послато: јун 19, 2015, 07:56:30 пре подне »
А какав је у питању хаплотип који је приказан на горњој карти у Новом саду?


У питању је Србин из Војводине (Нови Сад).

Allele frequencies and population data for 17 Y-chromosome STR loci in a Serbian population sample from Vojvodina province

Miljen Maletin, Igor Veselinovic contributed 215 Haplotypes on July 3, 2008 to the population Novi Sad, Serbia (for reference see Veselinovic IS., Zgonjanin DM., Maletin MP., Stojkovic O., Djurendic Brenesel M., Vukovic RM., Tasic MM. (2008), 'Allele frequencies and population data for 17 Y-chromosome STR loci in a Serbian population sample from Vojvodina province.'

19 385 389I 389II 390 391 392 393 437 438 439 448 456 458 635 YH4

13 14-19 12 28 24 10 11 13 14 10 12 20 15 18 21 10

Чини се да је најближи Јаковићу (-2).

David Radonić

  • Гост
Одг: Хаплогрупа J1-PF7263, покушај историјске реконструкције
« Одговор #79 послато: јун 19, 2015, 08:47:56 пре подне »

У питању је Србин из Војводине (Нови Сад).

Allele frequencies and population data for 17 Y-chromosome STR loci in a Serbian population sample from Vojvodina province

Miljen Maletin, Igor Veselinovic contributed 215 Haplotypes on July 3, 2008 to the population Novi Sad, Serbia (for reference see Veselinovic IS., Zgonjanin DM., Maletin MP., Stojkovic O., Djurendic Brenesel M., Vukovic RM., Tasic MM. (2008), 'Allele frequencies and population data for 17 Y-chromosome STR loci in a Serbian population sample from Vojvodina province.'

19 385 389I 389II 390 391 392 393 437 438 439 448 456 458 635 YH4

13 14-19 12 28 24 10 11 13 14 10 12 20 15 18 21 10

Чини се да је најближи Јаковићу (-2).

Zanimljivo. liči na "naš" haplotip, ali nisam siguran. On na DYS458 ima 18 dok mi ostali imamo 17. Na 635 ima 21 dok ja, kao i uzorak iz Bosne (na 23 markera) imamo 22. Ali jeste dosta sličan.